Počet záznamů: 1
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala)
Údaje o názvu Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala) [rukopis] / Alexandra Pechová Další variantní názvy Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu tučňáci a konzervovaných ptačích mikrosatelitů u nesyta indomalajského (Mycteria leucocephala) Osobní jméno Pechová, Alexandra (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Cross-species amplification of microsatellites from Sphenisciformes and conserved avian microsatellites in painted stork (Mycteria leucocephala) Vyd.údaje 2014 Fyz.popis 54 Poznámka Ved. práce Petr Nádvorník Dal.odpovědnost Nádvorník, Petr (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra botaniky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova cross-species PCR amplifikácia * Mycteria leucocephala * mikrosatelitový lokus * polymorfizmus * cross.species PCR amplification * Mycteria leucocephala * microsatellite loc * polymorphism Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. slovenština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biologie Studijní obor Biologie - Geologie a ochrana životního prostředí kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00190263-659517843.pdf 54 458.8 KB 25.07.2014 Posudek Typ posudku 00190263-ved-308238800.doc Posudek vedoucího 00190263-opon-204249248.doc Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00190263-prubeh-358843775.pdf 13.11.2013 25.07.2014 27.08.2014 1 Hodnocení známkou Signatura Čár.kód Lokace Dislokace Info BP-BOT/100 (PřF-KBO) 3134517514 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad pouze prezenčně
V tejto bakalárskej práci som sa venovala hľadaniu nových polymorfných mikrosatelitových márkerov pre myktériu lysohlavú (Mycteria leucocephala) za využitia metódy cross-species PCR amplifikácie. V teoretickej časti som sa zaoberala podrobným opisom radu brodivcov (Ciconiiformes) a jeho piatim čeľadiam. Podrobnejšie som sa venovala opisu čeľadi bocianovitých kam patrí aj myktéria lysohlavá. Ako ďalšiemu som sa venovala teoretickému spracovaniu repetitívnej DNA z doposiaľ známych literárnych zdrojov. Väčšiu pozornosť som venovala opisu mikrosatelitov, ich deleniu, využitiu, mutáciam, navrhovaniu de novo a cross-species PCR amplifikácii. V poslednej časti som sa venovala popisu doposiaľ nájdeným polymorfným mikrosatelitovým lokusom u radu tučniakov, brodivcov, potápiek, konzervovaným vtáčím mikrosatelitom, EST mikrosatelitom a metódam ich vyhľadávania. V experimentálnej časti tejto bakalárskej práce som sa zaoberala vyhľadávaním polymorfných mikrosatelitových lokusov s využitím metódy cross-species PCR amplifikácie na genomickej DNA vyizolovanej zo 6 jedincov myktérie lysohlavej. Za týmto účelom som použila všetky doposiaľ známe mikrosatelity navrhnuté pre rad tučniaky, niekoľko mikrosatelitov z radu brodivce a potápky, EST mikrosatelity a konzervované vtáčie mikrosatelity. Experimentálnymi metódami som zistila u myktérie lysohlavej 17 nezávyslých polymorfných mikrosatelitov z testovaných 169 párov primerov. Z toho bolo 5 mikrosatelitov odvodených z radu tučniaky, 4 mikrosatelity odvodene z radu brodivce a 1 mikrosatelit odvodený od radu potápky. Z konzervovaných vtáčích mikrosatelitov vykazovali polymorfizmus 3 mikrosatelity a 1 mikrosatelit z EST sekvencií. Počet alel sa pohyboval od 2 do 5.I dedicated this thesis to a search of new polymorphic microsatellite markers for painted stork (Mycteria leucocephala), using the method of cross-species PCR amplification. In the theoretical part I dealt with a detailed description of a Ciconiiformes and its five families. More detailed, I described the stork family that includes also painted stork. Furthermore, I dealt with theoretical elaboration of repetitive DNA using literary sources known so far. I paid more attention to the description of microsatellites, their division, utilization, mutations and proposition of de novo and cross-species PCR amplification. In the last part, I described polymorphic microsatellite loci founded so far within the order of Sphenisciformes, Ciconiiformes, Podicipediformes, conserved avian microsatellites, EST microsatellites and their search methods. In the experimental part of the thesis, I dealt with a search of polymorphic microsatellite loci, using the method of cross-species PCR amplification on isolated genomic DNA from 6 painted storks. For this purpose I used all know microsatellites proposed for the order of Sphenisciformes, few microsatellites from the order of Ciconiiformes and Podicipediformes, EST microsatellites and conserved avian microsatellites. Using the experimental methods I found 17 independent polymorphic microsatellite loci out of the original 169 pairs of primers for painted stork. Five microsatellites were derived from the order of Sphenisciformes, 4 from the order of Ciconiiformes and 1 from the order of Podicipediformes. Three conserved avian microsatellites showed polymorphism and one was with EST sequence. The number of alleles varied from 2 to 5.
Počet záznamů: 1