Počet záznamů: 1  

Teoretické studium interakce xenobiotik s membránami

  1. Údaje o názvuTeoretické studium interakce xenobiotik s membránami [rukopis] / Jiří Prokop
    Další variantní názvyTeoretické studium interakce xenobiotik s membránami
    Osobní jméno Prokop, Jiří (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názTheoretical Study on Interaction of Xenobiotics with Membranes
    Vyd.údaje2015
    Fyz.popis72 s.
    PoznámkaVed. práce Michal Otyepka
    Oponent Karel Berka
    Dal.odpovědnost Otyepka, Michal, 1975- (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Berka, Karel, 1982- (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova xenobiotika * membrána * partiční koeficient * COSMOmic * afinita * xenobiotics * membrane * partition coefficient * affinity * COSMOmic
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programChemie
    Studijní oborFyzikální chemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00187298-215283748.pdf362 MB07.05.2015
    PosudekTyp posudku
    00187298-ved-764037875.docxPosudek vedoucího
    00187298-opon-471762523.docPosudek oponenta

    Cytochromy P450 se z velké části podílí na biotransformaci cizorodých látek v lidském organizmu. Jednotlivé formy cytochromu P450, které se podílí na biotransformačních procesech, jsou poměrně promiskuitní z hlediska substrátové specifity. Řada substrátů jsou amfifilní látky, které se mohou akumulovat v membránách. Cílem práce bylo posoudit, kde a s jakou afinitou se v membránách nachází substráty a odpovídající metabolity, které vzniknou po katalýze cytochromem P450. V současnosti nejsou spočítané hodnoty partičních koeficientů membrána-voda všech známých metabolitů šesti hlavních cytochromů P450 (3A4, 2C9, 2C19, 2D6, 1A2 a 2E1). Partiční koeficienty je možné získat pomocí celé řady metod a my jsme se rozhodli použít program COSMOmic pro porovnání těchto koeficientů. V naší studii srovnáváme partiční koeficienty, pozice minim a hodnoty penetrační bariéry třiceti substrátů s jejich metabolity. V některých případech jsme také kontrolovali, zda odlišná stereoizomerie nemůže ovlivnit výše zmíněné vlastnosti xenobiotik. Novinkou našeho přístupu je použití programu COSMOmic, což je program založený na kvantově-chemických výpočtech a algoritmu statistické termodynamiky. Z celkového počtu 134 párů metabolit-substrát má 67 % metabolitů nižší afinitu k membráně než jejich substrát. Nejpočetnější studovanou skupinou metabolitů je skupina hydroxyderivátů čítající 61 metabolitů. Hodnotu partičního koeficientu může významně ovlivnit i poloha substituované skupiny (hydroxylová funkční skupina u metabolitů ondansetronu nebo atorvastatinu).Cytochromes P450 play a key role in biotransformation of xenobiotics in the human body. Some cytochromes P450 that take place in biotransformation processes are quite promiscuous in case of specific substrates. Many substrates are amphiphilic molecules and these molecules are accumulated in the membranes. The objective of this work was to evaluate affinity and position in the membrane of studied substrates metabolized by cytochromes P450 and their metabolites. Nowadays, membrane-water partition coefficients for all known metabolites of six major cytochromes P450 (3A4, 2C9, 2C19, 2D6, 1A2 and 2E1) are not calculated. It is possible to get the partition coefficients by many kinds of methods and we decided to use COSMOmic program to compare these coefficients with each other. Our approach consists of comparison of thirty cytochromes P450 substrates with their known metabolites. In some cases we also checked whether different stereoisomerism of xenobiotics would change their partition coefficients, membrane affinities, penetration barriers and positions of minima (free energy) from the center of the membrane. The novel insight of our approach is using program COSMOmic, which is based on quantum-chemical calculations and a statistical thermodynamic algorithm. This algorithm is used for pairing of interacting surfaces. We observed that in 67 % of 134 totally studied metabolite-substrate pairs metabolites have lesser affinity to the membrane than the corresponding substrates. The largest group of studied metabolites is composed of 61 hydroxy metabolites. The value of partition coefficient can be strongly influenced by the position of substituted group (e.g. hydroxyl group of ondansetron or atorvastatin metabolites).

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.