Předložená diplomová práce se zabývá studiem derivatizovaných cukrů pomocí hmotnostní spektrometrie s ionizací elektrosprejem (ESI) a laserovou desorpcí ionizací za přítomnosti matrice (MALDI). Práce je rozdělena do několika kapitol. Teoretická část popisuje principy ionizačních technik a hmotnostních analyzátorů publikovaných v literatuře pro analýzu derivatizovaných cukrů. Dále jsou v této kapitole uvedeny jednotlivé derivatizační postupy používané pro cukry. Experimentální část je věnována přípravě vzorků, experimentálním podmínkám syntézy, instrumentaci a podmínkám měření. Kapitola Výsledky a diskuse je rozdělena do třech hlavních podkapitol. První podkapitola se zabývá optimalizací kvarternarizace cukrů a analýze pomocí hmotnostní spektrometrie s ESI a MALDI. Druhá podkapitola se zabývá návrhem a syntézou nového kvarternarizačního činidla na základě úvah o analytické všestrannější využitelnosti takového činidla a na základě podobnosti s komerčním činidlem. Byla syntetizována dvě činidla: (4-bromo-benzyl)-glycidyldimethyl-amonium jodid (BBGDMA) a benzyl-glycidyldimethyl-amonium jodid (BGDMA). Třetí část experimentální testuje kvarternarizované cukry dvěma novými činidly a popisuje výsledky měření těchto derivatizovaných cůkrů pomocí ESI a MALDI.This thesis is focused on the study of derivatized sugars by mass spectrometry with electrospray ionization (ESI) and matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI). It is divided into several chapters. The theoretical part describes principles of ionization techniques and mass analyzers which are published in literature about derivatized sugars analysis. Derivatization procedures for saccharides are also described in this chapter. Experimental part describes sample preparation, experimental conditions of the synthesis, instrumentation and measurement conditions. Section Results and Discussion is divided into three main chapters. First chapter is focused on optimization of quaternization and analysis of sugars by commercial available reagent glycidyltrimethylammonium chloride by ESI and MALDI. Second subchapter deals with design and synthesis of the new quaternization reagent under consideration of analytical versatile usability of such agents, and on the basis of similarity to the commercial agent. Two new reagents were synthetized: (4 bromobenzyl)-glycidyldimethylammonium iodide (BBGDMA) and benzylglycidyldimethylammonium iodide (BGDMA). The last part describes experimental testing of two new reagents and describes results of measurement derivatized sugars by ESI and MALDI.