Celochromozómovými próbami sestavenými z bakteriálních umělých chromozómů můžeme značit jednotlivé chromozómy rostlin s malými genomy. Využívá se přitom metody fluorescenční in situ hybridizace. Tato metoda se využívá ke sledování morfologie interfázních jader na něž se také zaměřuje teoretická část práce. Tato bakalářská práce se také zabývá změnami chromatinu způsobenými vlivem stresu na protoplasty. Cílem práce bylo sestavení celochromozómové próby chromozómu 2 Arabidopsis thaliana. Podařilo se však naznačit pouze čtvrtinu chromozómu 2. Tato část odpovídá organizátoru jadérka.Whole chromosome probes prepared from BAC vectors may be used to individually paint chromosomes of plants with small genomes. Fluorescence in situ hybridization is used for this purpose. The theoretical part focuses on using this method to study the morphology of interphase nuclei. This thesis also deals with changes in chromatin caused by the stress on protoplasts. The objective of this work was to assemble the whole chromosome probe for chromosome 2 of Arabidopsis thaliana. But only a quarter of the chromosome was successfully hybridised. This part of the chromosome responds to the nucleolus organizer.