Diplomová práce je věnována aplikaci práva EU českými nejvyššími soudy. Práce se zabývá aspekty aplikace práva EU před vstupem i po vstupu do Evropské unie Nejvyšším soudem a Nejvyšším správním soudem a vzájemně je porovnává. Zaměřuje se na přímou aplikaci a rozbor příslušných rozhodnutí, tak i nepřímou aplikaci a směrnice, které oba soudy nejčastěji vykládají ve svých rozhodnutích. Závěr práce je věnován předběžným otázkám, které jsou zkoumány jak z hlediska četnosti tak kvality, kdy nejzásadnější otázky, které byly předloženy Soudnímu dvoru, jsou podrobeny analýze.The thesis is devoted to the application of EU law by the Czech Supreme Court. This work deals with aspects of the application of EU law before and after joining the European Union, the Supreme Court and the Supreme Administrative Court and compare them. It focuses on the direct application and analysis of relevant decision and indirect application of a directive that both courts often interpret their decisions. The conclusion is devoted to the questions that are explored in terms of both frequency and quality, the most fundamental questions that have been submitted to the Court are analyzed.