Transplantace krvetvorných kmenových buněk je nepostradatelná pro léčbu některých maligních onemocnění krvetvorby, řady imunodeficiencí a metabolických chorob. Její výsledky jsou podstatně ovlivňovány geny hlavního histokompatibilního komplexu určujícími tkáňovou kompatibilitu a také dalšími geny zapojenými v imunitní odpovědi organismu a zánětu. Jednou z nejvýznamnějších potransplantačních komplikací zůstává přes veškerý pokrok v hematoonkologii, imunologii i imunogenomice stále nemoc štěpu proti hostiteli (GVHD, z angl. graft versus host disease). Jedná se o komplexní onemocnění, které je vyvoláno rozpoznáním pacientových antigenů dárcovskými T lymfocyty. Výskyt i závažnost nemoci štěpu proti hostiteli mohou být ovlivňovány geny spojenými s imunitní odpovědí a geny, které podmiňují zánětlivá onemocnění cílových tkání GVHD. V rámci experimentální části této bakalářské práce byl navržen a zaveden protokol pro typizaci vybraného polymorfismu genu ataxin-2-like, jehož mutace je spojena se zánětlivým onemocněním střev. Tento polymorfismus je tak relevantním kandidátem pro možnou asociaci s výskytem GVHD. Dále byla provedena analýza možného vztahu mezi variantami jiného kandidátního genu (integrin ?4, ITGA4) a GVHD na souboru 58 pacientů po transplantaci krvetvorných kmenových buněk. Nebyl zjištěn signifikantní rozdíl v nosičství alel ITGA4 mezi podskupinami pacientů s výskytem akutní nebo chronické GVHD a pacientů bez těchto komplikací. Získaná data naznačují, že studovaný polymorfismus genu ITGA4 významně neovlivňuje riziko GVHD.Hematopoietic stem cell transplantation is essential for treatment of many hematologic malignancies, series of immunodeficiency disorders and metabolic disorders. HSCT outcome is strongly influenced by the genes of major histocompatibility complex, that determine the tissue compatibility, and is also affected by further genes involved in immune response and inflammation. Despite all the progress in hematooncology, immunology and immunogenomics, graft-versus-host disease (GVHD) remains an important and frequent serious post-transplant complication. GVHD is a complex disease and is caused by donor T-lymphocytes recognizing patient?s antigens. The occurrence and severity of graft-versus-host disease can be affected by genes involved in immune response and also genes, which are implicated in the pathogenesis of diseases affecting target tissues of GVHD. In the experimental part of this bachelor thesis a protocol for typing of the selected polymorphism of the ataxin-2-like gene, which is associated with inflammatory bowel diseases, was designed and introduced. This polymorphism is considered as a plausible candidate for association with GVHD. Furthermore, an analysis of possible association between another candidate gene (integrin ?4, ITGA4) and GVHD was performed on the group of 58 patients after HSCT. No significant difference in the carriage of ITGA4 alleles was found when the patients with acute/chronic GVHD were compared with those without GVHD. These data suggest that investigated ITGA4 polymorphism does not substantially affect the risk of GVHD.