Počet záznamů: 1
Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u pelikána bílého (Pelecanus onocrotalus) a pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis)
Údaje o názvu Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u pelikána bílého (Pelecanus onocrotalus) a pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis) [rukopis] / Iveta Bartoňková Další variantní názvy Analýza a charakteristika polymorfních cross-species mikrosatelitů u pelikána bílého (Pelecanus onocrotalus) a pelikána skvrnozobého (Pelecanus philippensis) Osobní jméno Bartoňková, Iveta (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz The analysis and characterization of polymorphic cross-species microsatellites in Great White Pelican (Pelecanus onocrotalus) and Spot-billed Pelican (Pelecanus philippensis) Vyd.údaje 2013 Fyz.popis 81 s. : grafy, tab. + 1 CD Poznámka Ved. práce Petr Nádvorník Oponent Vladan Ondřej Dal.odpovědnost Nádvorník, Petr (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Ondřej, Vladan, 1975- (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova mikrosatelity * cross-species * pelikán * Pelecanidae * microsatellites * cross-species * Pelican * Pelecanidae Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Signatura Čár.kód Lokace Dislokace Info DP-KBB/100 (PřF-KBO) 3134515506 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad pouze prezenčně
Hledání mikrosatelitových lokusů de novo je časově i finančně náročné. Doposud byly v rámci rodu pelikán mikrosatelity odvozeny de novo pouze od pelikána bílého (Pelecanus onocrotalus) a pelikána severoamerického (P. erythrorhynchos). Tato práce je zaměřena na cross-species PCR amplifikaci u pelikána bílého a pelikána skvrnozobého (P. philippensis). K nalezení polymorfních lokusů u daných dvou druhů pelikánů byly použity mikrosatelitové lokusy odvozené od příbuzných druhů ptáků. V průběhu této práce bylo nalezeno, ověřeno a charakterizováno celkem 82 párů primerů amplifikujících 84 lokusů u pelikána bílého Z těchto 82 párů primerů bylo 10 odvozeno de novo od pelikána bílého a byly charakterizovány v rámci této práce kvůli analýze vazby s ostatními charakterizovanými polymorfními lokusy. U pelikána skvrnozobého jsem pak nalezla 18 polymorfních mikrosatelitů. U všech lokusů byly zjištěny alelové konstituce u většího počtu jedinců a následně byly charakterizovány s pomocí statistických programů. Na základě získaných dat byly stanoveny sady mikrosatelitových lokusů, které by bylo možno využít k ověření paternity u těchto dvou druhů pelikánů a pro populačně-genetické studie. Byly nalezeny také lokusy vázané na pohlaví, z nichž jeden lokus je univerzálním pohlavním markerem pro všechny doposud zkoumané druhy pelikánů.Searching for microsatellite loci de novo is time and money consuming process. So far, de novo microsatellites were derived only from the Great White Pelican (Pelecanus onocrotalus) and American White Pelican (P. erythrorhynchos). This thesis is focused on cross-species PCR amplification in Great White Pelican and Spot-billed Pelican. Microsatellites originally derived from DNA of closely related species were used to test polymorphism in these two pelican species. During this thesis, totally 82 polymorphic primer pairs amplifying 84 microsatellite loci were found and characterized in Great White Pelican, 18 polymorphic loci in Spot-billed Pelican respectively. Ten of 82 polymorphic primer pairs found in Great White Pelican were originally derived from this species and genotyped during this thesis to analyze linkage of the loci. Genotyping was conducted for all of these polymorphic loci in higher number of individuals and all of these loci were characterized using statistical programs. Based on obtained data, sets of microsatellite loci were selected to be used for paternity confirmation and population studies. Sex-linked loci were also found and one of them that seems to be universal marker for sex determination for all pelican species tested so far.
Počet záznamů: 1