Práce porovnává cíle, přístupy a nástroje, které EU a NATO volí pro své zahraniční operace, za účelem poukázat na problémy, které pro obě organizace plynou ze současné neuspořádanosti jejich vztahů. Je argumentováno, že postupné splývání činností obou organizací v oblasti zahraničních operací, způsobené změnami v systému mezinárodních vztahů po skončení studené války, mezi nimi vyvolalo střet zájmů, který za absence jasného nastavení vztahů a dělby práce, poškozuje obě strany. Cílem práce je následně zhodnotit, do jaké míry nejnovější dokumenty, upravující fungování obou organizací, přispívají k nápravě současného stavu.This writing compares objectives, approaches and instruments, which EU and NATO choose for their foreign operations, with an aim to point out problems that plague both organizations due to contemporary state of their relations. It is argued that gradual homogenization of activities of both organizations in the area of foreign operations, caused by the changes in the system of international relations in the post Cold War period, cause a conflict of interests between them, which in the absence of a clear division of labor damages both parties. Objective of the thesis is to evaluate the extent to which the contemporary documents that set the internal workings of both organizations lead to correction of the current state of affairs.